Soweit ich mich erinnern kann man das Vollbild nicht nur im Manifest festlegen, sondern auch, indem man die "onCreate()"-Methode der Activity überschreibt.
Dort kann man dann je nachdem ob Vollbild gewünscht ist oder nicht, dem Fenster die entsprechenden Flags mitgeben. Das war ganz einfach, als ich das gemacht hatte. Die onCreate()-Methode wird halt nur bei jedem Start aufgerufen und nicht zwischendurch.
Nur ob ein toggeln funktioniert wärend das Programm läuft, weiß ich nicht (mein Versuch wäre es finish() und dann startActivity(...) aufzurufen) - wäre aber in diesem Fall auch nicht schlimm.
lg
Adrian